Etter uttreden skattlegges selskapet etter de ordinære reglene, og med utgangspunkt i de verdiene som ble fastsatt i forbindelse med uttreden fra rederiskatteordningen. De fastsatte skattemessige verdiene for driftsmidler, danner grunnlag for avskrivninger utenfor rederiskatteordningen. Dette gjelder også den fastsatte verdien av eventuell egenutviklet forretningsverdi, som dermed skal behandles som om det var ervervet forretningsverdi, se Skatteklagenemnda SKNS1-2024-15. Dersom selskapet har gjenstående saldo på gevinst-/tapskonto fra inntreden i rederiskatteordningen, videreføres den på ordinært vis etter uttreden.