For foretak som har fått pålegg fra støttegiver om å tilbakebetale offentlig støtte fordi den er i strid med EØS-avtalens regelverk, skal støttegiver (Skatteetaten) kreve Skattefunnfradrag tilbakebetalt, jf. støtteprosessloven § 12.

Foretak som har unnlatt å etterkomme krav om tilbakebetaling av støtte kan ikke kreve Skattefunnfradrag så lenge tilbakebetalingskravet består. Dette gjelder foretak som har fått krav om tilbakebetaling fra Skatteetaten og/eller andre norske støttegivere som faller innenfor EØS-avtalens regelverk om statsstøtte, jf. Gruppeunntaksforordningen artikkel 1, punkt 4 a.